Las aguas residuales se canalizan en un sedimentador tipo cono inhof, consiguiendo una  concentración de sólidos totales en la parte  inferior apropiada para cargar un digestor con una  suspensión de estiércol de cerdo. Estos Iodos alimentan un reactor híbrido anaerobio de  flujo  ascendente (RHAFA), del que se obtiene biogás (metano y bióxido de carbono). Produciendo  lodos estabilizados que son  depositados en un lecho de secado, los lixiviados generados en el  lecho de secado serán enviados al reactor anaerobios de flujo  ascendente para el tratamiento de  los líquidos.

La fase liquida procedente del sedimentador entra al sistema de tratamiento de líquidos a base de  un RHAFA, donde se consigue una  remoción mínima del 80% de la carga orgánica. El efluente  del reactor es muy rico en nutrientes, por lo cual, este se hace circular a  través de una ciénega  construida  profusamente plantada con hidrófitas (plantas acuáticas), que permitirá retirar la mayor  cantidad de  nutrientes y sólidos suspendidos, preparando el agua para su descarga y que cumpla  con la normatividad ambiental vigente.

El lodo es retirado del lecho de secado y pasara a un proceso de secado para su posterior  empaque como abono orgánico Este puede  ser ocupado en las áreas verdes de las instalaciones  o comercializado para uso agrícola.

Para aprovechar el biogás generado, de acuerdo a las necesidades de la granja y el volumen de  biogás producido,  se instalan lámparas a  biogás o generadores de energía eléctrica. Esto  disminuye el consumo de electricidad nocturno, cuando en las granjas porcícolas el  consumo de  luz aumenta, al crear un ambiente artificial de día para que los animales se sometan a un régimen  de alimentación más  intensa, y de esta manera los animales tengan una mayor tasa de aumento  de peso.